在马来西亚申请ISO9001质量管理体系认证，需要遵循以下步骤：

了解ISO9001标准：首先需要了解ISO9001质量管理体系标准的具体要求和内容，确保企业具备满足该标准所需的基础设施和流程。

选择认证机构：选择一家有资质的认证机构，例如马来西亚标准局（SIRIM）或其他国际认证机构。了解认证机构的审核要求和流程，以确保企业能够顺利通过审核。

建立质量管理体系：根据ISO9001标准建立企业的质量管理体系，包括质量方针、质量目标、质量策划、质量控制、和质量改进等方面的内容。

实施质量管理体系：在企业内部全面实施建立的质量管理体系，确保各部门和员工都遵循体系要求，并保持良好的工作状态。

进行内部审核和管理评审：定期进行内部审核和管理评审，检查质量管理体系的有效性和符合性，发现问题及时采取措施进行改进。

申请认证审核：向选定的认证机构提交申请，并预约审核时间。在审核前准备相关的文件和资料，确保审核过程顺利通过。

接受认证机构审核：认证机构派遣审核员对企业进行现场审核，检查企业是否符合ISO9001标准要求。企业应配合审核员的工作，提供所需的信息和证据。

获得认证证书：如果企业顺利通过审核，认证机构将颁发ISO9001质量管理体系认证证书。企业应持续维护质量管理体系，并定期进行内部审核和监督审核，以确保体系的有效性和符合性。

需要注意的是，ISO9001质量管理体系认证是一个长期的过程，需要企业持续投入和改进。同时，还需要关注马来西亚相关法规和标准的更新，以确保企业始终符合要求。