在日本申请ISO 13485质量体系认证，需要按照以下步骤进行：

了解ISO 13485标准要求：详细了解ISO 13485标准的要求，确保您的组织已经具备符合标准的条件或者需要进行哪些改进。

认证机构选择：选择一个被认可的ISO 13485认证机构。您可以通过搜索网络、咨询行业人士或向认证机构数据库查询找到合适的认证机构。

联系认证机构：一旦确定认证机构，您可以联系他们，表达您对ISO 13485质量体系认证的兴趣，并了解具体的申请程序、所需材料和费用等信息。

准备申请材料：根据认证机构提供的要求，准备并提交ISO 13485质量体系认证申请。申请中可能需要提供组织的背景信息、质量管理体系文件和相关的证明文件等。

文件审核：认证机构会对您提交的质量管理体系文件进行审核，评估其是否符合ISO 13485标准的要求。

现场审核：如果文件审核通过，认证机构将安排现场审核。审核团队会到您的组织进行现场审核，确认质量管理体系在实际运作中的有效性和合规性。

纠正和改进：根据审核结果，您可能需要进行一些纠正和改进，以满足ISO 13485标准的要求。

认证决定：审核完成后，认证机构将作出认证决定。如果符合要求，您的组织将获得ISO 13485质量体系认证。