在澳大利亚申请义齿注册时，需要准备的质量管理手册和程序文件主要包括以下几个方面：

质量管理手册是组织的质量管理体系文件，它涵盖了整个质量管理体系的概述和要求。质量管理手册应包括以下内容：

质量政策：明确组织的质量方针和目标，以及为实现这些目标所采取的措施。

组织结构和职责：描述组织内部的质量管理结构，以及各相关部门和岗位的职责和权限。

质量管理流程和程序：概述质量管理的主要流程和程序，包括产品设计、生产、检验、售后服务等环节的质量控制要求。

除了质量管理手册外，还需要准备一系列的程序文件来支持和规范质量管理体系的实施。这些程序文件可能包括：

内部审核程序：用于规定内部审核活动的实施程序和要求，包括审核计划、审核程序、审核报告等。该程序旨在质量管理体系的有效性和符合性。

不合格品管理程序：用于管理和处理不合格品的程序，包括不合格品的识别、处理、追溯和纠正措施等。该程序有助于不合格品得到及时有效的控制和处理。

变更管理程序：用于管理产品设计、工艺或文件等方面的变更，包括变更申请、变更评估、变更批准和变更记录等。该程序旨在变更得到适当的控制和管理，以避免对产品质量造成不利影响。

文件控制程序：用于管理组织的文件和记录，包括文件编制、审批、发布、存档和修订等流程。该程序有助于文件的准确性和可追溯性，以及文件的及时更新和分发。

培训程序：用于规定培训活动的实施程序和要求，包括培训计划、培训内容、培训记录等。该程序旨在提高员工的质量意识和技能水平，以他们能够满足质量管理体系的要求。

此外，根据具体情况，可能还需要准备其他与质量管理相关的文件，如风险管理计划、产品验证和确认程序、顾客反馈处理程序等。这些文件将共同构成质量管理体系的完整框架，为义齿产品的注册申请提供有力的支持。

在准备这些质量管理手册和程序文件时，应它们符合澳大利亚相关法规和标准的要求，并能够有效支持组织的质量管理体系的实施和运作。同时，还需要注意文件的完整性和准确性，以及文件的及时更新和分发。