胶原蛋白办理香港注册的证书通常由香港药品监管机构发放。在香港，药品、医疗器械等医疗相关产品的注册和监管工作由香港药品监管机构负责。该机构会对提交的注册申请进行审核和评估，包括对产品的安全性、有效性、质量等方面的评估。如果申请符合要求，香港药品监管机构会颁发相应的注册证书，允许产品在香港合法销售和使用。

需要注意的是，具体的注册要求和流程可能因产品类型和目标市场的不同而有所不同。因此，建议在办理胶原蛋白香港注册前，先了解相关法规和要求，并咨询机构或律师，以确保符合要求并准备齐全的资料。