是的，胶原蛋白的菲律宾PFDA注册通常会有一个有效期限。注册证书的有效期取决于产品类型、法规要求以及产品特性等因素。一般来说，大多数产品的菲律宾PFDA注册有效期为5年。

在注册有效期内，制造商需要遵守菲律宾的相关法规和标准，确保产品的合规性和质量稳定性。同时，菲律宾PFDA可能会对产品进行定期的监督检查，以确保制造商的质量管理体系和生产设施符合要求。

当注册证书到期时，制造商需要重新提交申请，并按照菲律宾PFDA的要求进行重新注册或续注，以保持产品的合法销售和进口。

需要注意的是，菲律宾PFDA注册的有效期限可能会根据法规和产品的变化而有所不同。因此，建议制造商随时关注菲律宾的相关法规和通知，以确保及时了解注册有效期限的变化和要求。同时，与的代理机构或咨询机构合作，可以获得更准确的指导和服务，帮助制造商顺利完成注册和续注。