在菲律宾申请ISO 9001质量管理体系认证需要遵循以下步骤：

准备质量管理体系文件： 首先，您需要建立符合ISO 9001标准要求的质量管理体系文件，包括质量手册、程序文件、工作指导书等。这些文件应该覆盖您组织的所有质量管理活动和流程。

实施质量管理体系： 确保您的组织全面实施了质量管理体系文件中规定的质量管理程序和流程，并确保所有员工了解并遵守这些程序。

内部审核： 进行内部审核，以评估质量管理体系的有效性和符合性。内部审核应由经过培训的内部审核员进行，目的是发现潜在的问题并采取纠正措施。

管理评审： 进行管理评审，由高层管理人员审查质量管理体系的运行情况和绩效表现。确保组织的管理层对质量管理体系的有效性和改进提出建议和支持。

选择认证机构： 选择一家合适的认证机构进行认证审核。确保选择的认证机构在菲律宾有资质，并被国际认可。

申请认证审核： 向选择的认证机构提交ISO 9001认证审核申请。认证机构将安排认证审核员对质量管理体系进行评估，以确保其符合ISO 9001标准的要求。

认证审核： 认证审核通常包括两个阶段：首先是文件审核，审核员将审核您的质量管理体系文件是否符合ISO 9001标准的要求；接着是现场审核，审核员将到您的组织现场进行实地审核，评估质量管理体系的实际运行情况。

认证决定： 完成审核后，认证机构将根据审核结果作出认证决定。如果质量管理体系符合ISO 9001标准的要求，认证机构将颁发ISO 9001质量管理体系认证证书。

维持和改进： 持续改进质量管理体系，不断提高组织的绩效和客户满意度。定期进行内部审核和管理评审，以确保质量管理体系的有效性和持续改进。