是的，通常情况下，在人工关节申请台湾注册时，需要提供电磁兼容性报告。电磁兼容性是指设备在电磁环境中的性能表现，以及其对其他设备和环境中的电磁场的影响程度。

对于医疗器械和医疗器材，包括人工关节，其电磁兼容性是非常重要的，因为它们可能在医疗设施中与其他电子设备和医疗设备一起使用。为了确保安全和有效性，医疗器械需要在电磁环境下表现良好，且不会对其他设备或患者造成干扰或损害。

因此，在申请台湾注册时，需要提供符合相关标准的电磁兼容性报告，以证明产品在电磁环境中的安全性和合规性。这些报告通常包括产品的电磁兼容性测试结果，例如电磁放射测试和电磁感应测试等。

为了确保报告的准确性和可信度，应该由具有相关资质和认证的第三方实验室进行测试，并且报告中应包括详细的测试方法、实验结果、数据分析和结论。