重组胶原蛋白申请印度注册时，通常需要准备以下证明文件和质量计划：

一、证明文件

公司资质证明：包括公司的营业执照、税务登记证、组织代码证等，用以证明公司的合法经营资格。

产品注册证明：如果产品在其他国家或地区已经注册，提供相关注册证明文件，有助于加快印度的注册进程。

知识产权证明：如专利证书、商标注册证等，用以证明产品的技术独特性和创新性。

质量管理体系认证证书：如ISO 13485认证证书，证明公司具有符合的质量管理体系。

生物相容性和安全性评价报告：这些报告应详细展示产品对人体的安全性和生物相容性评估结果，如细胞毒性测试、皮肤刺激测试等。

临床试验数据（如果适用）：如果产品已经进行了临床试验，需要提供完整的试验计划、试验报告等数据，以证明产品的安全性和有效性。

二、质量计划

产品质量计划：详细描述产品从原材料购买、生产、检验到终交付给客户的全过程质量控制措施。

生产和检验程序：包括详细的生产工艺流程图、检验标准和操作规范，产品的一致性和质量稳定性。

不合格品控制和处理程序：规定对不合格品的识别、隔离、处理及预防措施，防止不合格品流入市场。

纠正和预防措施计划：针对可能出现的质量问题，制定预防和纠正措施，并持续改进质量管理体系。