手术导航系统申请香港注册的花销主要包括以下几个方面：

一、管理部门费用

注册申请费：这是向香港特别行政区管理部门提交注册申请时需要支付的费用。

审核与评估费：在审核与评估阶段，根据产品特性和复杂程度，可能需要支付额外的审核或评估费用。

二、技术文件准备费用

技术规格与性能数据整理：需要人员对产品进行详细的技术规格和性能数据整理，这会产生一定的费用。

安全性与效能数据测试：为产品的安全性和有效性，需要进行相关的测试和验证，这些测试通常需要由的实验室进行，费用会根据测试项目和实验室的收费标准而有所不同。

电磁兼容性测试：对于涉及电磁辐射的医疗器械，还需要进行电磁兼容性测试，以产品符合相关标准。

三、质量管理体系文件费用

质量管理体系建立与维护：如果申请者还没有建立符合ISO 13485或其他相关质量管理标准的质量管理体系，那么需要聘请的咨询或顾问来帮助建立和维护，这将产生一定的费用。

审核与认证费：质量管理体系建立后，还需要经过第三方审核的审核和认证，以其符合相关标准。这些审核和认证也会产生一定的费用。

四、临床试验费用（如适用）

临床试验设计与实施：如果手术导航系统需要进行临床试验以证明其安全性和有效性，那么临床试验的设计与实施会产生一定的费用。

数据分析与报告撰写：临床试验结束后，需要对收集到的数据进行分析，并撰写详细的临床试验报告，这也会产生一定的费用。

五、代理与咨询服务费用（如适用）

代理服务费：如果申请者不熟悉香港的注册流程和要求，可能需要聘请的代理公司来提供代理服务，包括准备申请资料、与监管沟通、协调审核与评估等环节。这些服务会产生一定的费用。

咨询服务费：申请者还可以聘请的咨询公司来提供咨询服务，包括法规解读、申请策略制定、技术文件准备指导等。这些咨询服务也会产生一定的费用。

六、其他费用

文件翻译与公证费：如果申请资料需要翻译成英文或其他语言，并需要进行公证或认证，那么会产生相应的翻译与公证费用。

邮寄与通讯费：在申请过程中，申请者需要与监管进行多次沟通和交流，这会产生一定的邮寄和通讯费用。

需要注意的是，以上费用仅为大致估算，并且可能会因政策调整、服务及具体服务内容等因素而有所变动。在实际操作中，申请者需要提前做好预算规划，并咨询的注册代理或会计师以获取较准确的信息。