手术导航系统申请泰国注册时，确实需要提供生产设施合规性报告。这是根据泰国食品药品监督管理局（TFDA）的注册要求来确定的。

生产设施合规性报告是为了证明生产场所符合当地和国际的质量管理标准，例如ISO 13485。这些报告能够展示制造商在生产过程中是否遵循了必要的质量控制程序，以产品的安全性和有效性。在泰国注册医疗器械时，提交生产设施合规性报告是注册申请的一部分，旨在向TFDA证明制造商的生产设施符合相关的质量和安全标准。

生产设施合规性报告通常应包括以下内容：

设施描述：详细描述生产设施的布局、设备和环境控制。

质量管理体系认证：如ISO 13485认证证书，证明制造商已建立并实施有效的质量管理体系。

设施审核报告：内部和外部审核报告，显示设施是否符合相关标准。这可能包括第三方审核的审核报告，证明设施符合ISO 13485等标准。

环境控制措施：说明生产环境如何符合相关标准，以防止污染和交叉感染。

设备校准和维护记录：显示关键设备的校准和维护情况。

因此，在准备手术导航系统申请泰国注册时，制造商应生产设施符合相关标准，并准备详细的生产设施合规性报告。同时，与TFDA或认证进行沟通，了解具体的报告要求和格式，以报告能够符合TFDA的审核要求。