低频脉冲磁治疗仪申请ISO13485质量管理体系认证的流程相对复杂，以下是一个详细的指南：

首先，需要深入了解ISO13485标准，理解其对医疗器械质量管理体系的具体要求。这包括了解标准的条款、原则、术语和定义等，以便能够准确地评估现有质量管理体系与标准的差距，并制定相应的改进措施。

在申请ISO13485质量管理体系认证之前，需要准备一系列的材料。这些材料通常包括：

1. 申请书：由申请方授权代表签署的产品质量认证申请书和质量体系认证申请书。

2. 质量手册：申请单位的质量手册，必要时还需提供企业的程序文件。

3. 产品标准：申请认证的产品或质量体系覆盖的产品标准。

4. 执行标准声明：申请方声明执行的标准。

5. 医疗器械产品注册证：低频脉冲磁治疗仪的医疗器械产品注册证（复印件）。

6. 生产流程说明：产品生产全过程情况总结，产品生产流程及特殊过程、关键过程说明。

7. 销售与反馈：近三年产品销售情况及用户反馈信息。

8. 外购外协件清单：主要外购、外协件清单。

9. 其他材料：如企业产品目录、产品简介、产品宣传材料等，以及为其提供过认证咨询的组织和人员的信息。

依据ISO13485标准，建立或优化企业的质量管理体系。这包括编写质量手册、程序文件、工作指导书等体系文件，并这些文件符合标准的要求。同时，还需要设立专门的质量管理部门或质量专员，负责体系的运行和维护。

在进行ISO13485质量管理体系认证申请之前，需要进行至少一次内部审核和一次管理评审。内部审核旨在检查质量管理体系的运行状况，发现潜在的问题并进行整改。管理评审则是对质量管理体系的适宜性、充分性和有效性进行评价，以其满足标准的要求和企业的实际需求。

挑选具有ISO13485认证资质的认证，并了解其认证流程、费用、周期等信息。然后向选定的认证提交认证申请，包括企业基本信息、产品范围、体系文件等相关资料。与认证商定审核的具体时间、地点、人员等事宜。

认证会派出审核员前往申请企业进行现场审核。审核内容涵盖文件审核、现场检查、员工访谈等方面。审核结束后，审核组会与企业代表召开末次会议，通报审核发现的不符合项，并提出相应的整改要求。企业需要根据审核组提出的不符合项，制定详细的整改计划并认真实施。整改完成后，向审核组提交整改报告和相关证据。

如果企业的整改情况符合ISO13485标准的要求，认证将向企业颁发ISO13485认证证书。证书上会注明企业名称、产品范围、证书编号、有效期等信息。在证书有效期内，认证通常会对企业进行至少一次的年度监督审核，以企业的质量管理体系持续有效运行。

需要注意的是，不同认证的要求和流程可能会有所不同。因此，在办理认证前，建议与所选认证进行详细沟通，以准备充分并顺利通过认证。