重组胶原蛋白申请巴西ANVISA注册时，需要提交一系列的质量管理手册和程序文件，以确保产品的制造和质量控制符合巴西的法规和标准。这些文件通常包括但不限于以下内容：

1. 质量管理体系手册：这是一份概述公司质量管理体系的文档，应包含公司的质量政策、组织结构、职责、流程和程序等信息。这个文件应清晰地展示公司如何实施和维护质量管理体系，以确保产品的质量和安全性。

2. 生产工艺流程和控制文件：详细描述产品的生产工艺流程，包括原材料接收、生产、检验、包装和运输等各个环节。同时，应提供相关的控制文件，如操作指导书、设备维护计划、清洁和消毒程序等，以确保生产过程的稳定性和可重复性。

3. 质量控制和检验程序：提供详细的质量控制和检验程序，包括原材料检验、过程检验、成品检验等。这些程序应确保产品符合预设的质量标准，并及时发现和纠正任何不符合要求的情况。

4. 不合格品控制程序：描述如何处理在生产过程中发现的不合格品，包括标识、隔离、评估和处置等。这个程序应确保不合格品不会误用或误售，并防止类似问题再次发生。

5. 纠正和预防措施程序：提供一套完整的纠正和预防措施程序，以应对任何可能影响产品质量的问题。这个程序应包括问题的识别、调查、原因分析、纠正措施的实施和验证等步骤。

6. 内部审核和管理评审程序：描述如何进行内部审核和管理评审，以确保质量管理体系的持续有效性。这些程序应包括审核计划、审核员资质、审核过程、不符合项的纠正和预防措施等。

7. 培训程序：提供员工培训计划，确保员工具备必要的技能和知识来执行他们的职责。这个培训计划应包括培训内容、培训方式、培训频率和效果评估等。