在巴西申请家用红外仪注册时，需要准备的质量管理手册和程序文件主要包括以下几个方面：

质量管理手册是描述组织质量管理体系的文件，它阐明了组织的质量方针、目标以及为实现这些目标所采取的措施和程序。对于家用红外仪的注册申请，质量管理手册应包括以下内容：

质量方针和目标：明确组织的质量方针、目标以及与质量相关的承诺和期望。

组织结构和职责：描述组织的质量管理体系结构，明确各部门的职责和权限。

质量管理体系程序：概述质量管理体系的主要程序，如文件控制、记录控制、内部审核、管理评审等。

产品实现过程：描述家用红外仪的设计、开发、生产、检验、包装、储存和运输等过程的质量控制要求。

风险管理：评估家用红外仪在使用过程中可能存在的风险，并制定相应的风险控制措施。

程序文件是描述质量管理体系中各项具体活动的操作方法和步骤的文件。对于家用红外仪的注册申请，需要准备的程序文件可能包括：

文件控制程序：规定文件的编制、审批、发布、更改、回收和销毁等过程，文件的准确性和有效性。

记录控制程序：规定记录的标识、储存、保护、检索、保留和处置等过程，记录的完整性和可追溯性。

设计和开发控制程序：描述家用红外仪的设计和开发过程，包括需求分析、设计输入、设计输出、设计评审、设计验证和设计确认等环节。

购买控制程序：规定原材料的购买、验收、检验和储存等过程，购买的原材料符合质量要求。

生产过程控制程序：描述家用红外仪的生产过程，包括生产计划、生产准备、生产操作、过程检验和成品检验等环节。

销售和售后服务控制程序：规定家用红外仪的销售、交付、售后服务和顾客反馈等过程，顾客满意度和产品的持续改进。

不合格品控制程序：描述不合格品的标识、隔离、评审、处置和预防等过程，防止不合格品的非预期使用。

内部审核和管理评审程序：规定内部审核和管理评审的计划、实施、报告和跟进等过程，质量管理体系的有效性和持续改进。

除了质量管理手册和程序文件外，还需要准备其他与家用红外仪注册申请相关的文件，如：

产品技术规格和描述：详细描述家用红外仪的技术规格、性能参数和使用方法等。

安全性和有效性数据：包括生物相容性测试报告、电磁兼容性测试报告、临床试验数据等。

产品标签和说明书：提供产品的标签和说明书，用户能够正确使用和理解产品。

质量管理体系认证证书：如ISO 13485等质量管理体系认证证书，证明组织的质量管理体系符合要求。

综上所述，巴西家用红外仪申请注册需要准备的质量管理手册和程序文件涉及多个方面，需要文件的完整性、准确性和合规性。同时，还需要关注ANVISA的较新要求和指南，以注册申请的顺利进行。