在台湾生产重组胶原蛋白产品的流水线布局设计应遵循以下原则：

1. 流程效率原则：首先，流水线布局应确保生产流程的高效性。这包括原材料的输入、加工、质检、包装到成品的输出等各个环节，都应设计得尽可能顺畅，减少物料搬运和等待时间，提高生产效率。

2. 灵活性原则：考虑到未来可能的产品变化或市场需求调整，流水线设计应具有一定的灵活性。例如，采用模块化设计，使得部分环节可以方便地进行调整或替换，以适应不同的生产需求。

3. 安全性原则：在生产过程中，员工的安全应始终放在首位。流水线布局应避免潜在的安全隐患，如锐利的边角、高温区域等，并设置必要的安全警示和防护措施。

4. 清洁与卫生原则：重组胶原蛋白作为生物材料，对生产环境的清洁和卫生要求极高。因此，流水线布局应便于清洁和维护，确保生产环境的洁净度符合相关标准。

5. 空间利用原则：在有限的厂房空间内，应合理布局流水线，充分利用空间资源。通过合理的设备摆放和物料流动设计，实现空间的大化利用。

6. 环保与节能原则：在设计过程中，应考虑环保和节能的要求。例如，选择低能耗的设备、合理利用自然光、设置节能照明等，以减少生产过程中的能源消耗和环境污染。

7. 人性化原则：流水线布局应考虑员工的工作习惯和舒适度，如设置合适的操作高度、提供舒适的休息区域等，以提高员工的工作效率和满意度。