重组胶原蛋白申请埃及注册时，需要准备的证明文件和质量计划可以归纳如下：

1. 公司资质证明：

2. 制造商的GMP（良好生产规范）证书

3. ISO 13485证书（如适用，证明公司符合医疗器械质量管理体系要求）

4. 营业执照、生产许可证等

5. 知识产权证明：

6. 专利证书（如果产品涉及专利）

7. 商标注册证（如果产品有注册商标）

8. 原料来源证明：

9. 原料供应商的合格证明或证书

10. 原料的进口许可证明（如适用）

11. 代理授权文件：

12. 如果通过代理申请，需提供代理授权文件

13. 注册费用支付证明：

14. 按照要求缴纳注册费用后，保留的支付凭证

15. 其他相关证明文件：

16. 如产品宣传资料、广告审批文件（如适用）

1. 质量管理体系文件：

2. 质量手册：描述公司的质量管理体系和运作方式

3. 程序文件：涉及产品生产和质量控制的具体程序

4. 记录与报告：如生产过程记录、质量控制记录、检验报告等

5. 质量控制计划：

6. 明确各个生产阶段的质量控制点、抽样方案、检验标准等

7. 详细描述对原材料、半成品和成品的检验和控制方法

8. 稳定性测试计划：

9. 长期和加速稳定性测试计划，产品在存储和使用过程中的稳定性

10. 风险管理计划：

11. 风险识别、评估和控制措施，产品在设计、生产和使用过程中的安全性

12. 清洁和消毒计划：

13. 生产设备和环境的清洁和消毒，防止交叉污染