在加拿大义齿申请注册的过程中，需要准备的质量管理手册和程序文件主要包括以下几个方面：

质量管理手册是描述组织质量管理体系的纲领性文件，它应明确组织的质量方针、质量目标以及为达到这些目标所采取的措施和方法。在义齿申请注册时，质量管理手册应包含但不限于以下内容：

1. 质量方针和目标：阐述组织对质量的基本态度和追求，以及具体的质量目标。

2. 质量管理体系结构：描述质量管理体系的组成要素、相互关系以及它们在组织中的位置和作用。

3. 质量职责和权限：明确各部门和人员在质量管理体系中的职责和权限。

4. 质量过程和控制方法：描述关键质量过程及其控制方法，以产品质量的稳定性和一致性。

程序文件是描述质量管理体系中特定过程或活动的具体步骤和方法的文件。在义齿申请注册时，需要准备的程序文件主要包括：

1. 文件控制程序：规定文件的编制、审批、发布、更改、作废等过程，以文件的准确性和有效性。

2. 记录控制程序：规定记录的标识、储存、检索、保护、保留和处置等过程，以记录的完整性和可追溯性。

3. 设计和开发控制程序：描述设计和开发过程的各个阶段、任务、责任人以及评审、验证和确认等活动的具体要求。

4. 购买控制程序：规定购买过程、供应商选择、评价和重新评价等要求，以购买的原材料和零部件符合规定的质量要求。

5. 生产过程控制程序：描述生产过程的策划、实施、监视和测量等要求，以产品质量的稳定性和一致性。

6. 检验和试验控制程序：规定进货检验、过程检验和检验的要求和方法，以产品质量符合规定的要求。

7. 不合格品控制程序：描述不合格品的标识、隔离、评审、处置和防止再发生的措施等要求。

8. 纠正和预防措施控制程序：规定纠正和预防措施的制定、实施和验证等要求，以消除潜在的不合格原因并防止不合格的再发生。

此外，根据加拿大医疗器械法规的具体要求，可能还需要准备其他特定的程序文件，如风险管理程序、临床试验程序（如适用）等。

在准备这些质量管理手册和程序文件时，应它们符合加拿大的相关法规和标准，并能够满足加拿大卫生部对医疗器械注册的要求。同时，这些文件还应具有可操作性和可检查性，以便于在实际生产过程中得到有效执行和持续改进。