重组胶原蛋白申请印度注册确实可能存在地区差异。这主要是因为印度的医疗器械注册制度虽然由中央药品标准控制组织（CDSCO）统一监管，但各个地区可能会有一些具体的执行细节和标准上的差异。

首先，不同的地区可能有不同的注册要求和流程。虽然基本的注册法规和标准是一致的，但各个地区可能会根据当地的实际情况和需要，制定一些具体的执行细节和标准。因此，在申请注册时，需要仔细了解当地的具体要求和流程，以确保申请能够顺利通过。

其次，不同地区的监管机构可能会有不同的审核标准和重点。这取决于当地的医疗资源、疾病情况和监管能力等因素。因此，在申请注册时，需要了解当地监管机构的审核标准和重点，并根据实际情况进行调整和完善，以提高申请的通过率。

后，不同地区的市场环境和需求也可能存在差异。这包括市场规模、竞争情况、消费者需求等方面。因此，在申请注册前，需要对当地市场进行充分的研究和分析，了解当地的市场环境和需求，以便更好地制定市场策略和推广计划。

总之，重组胶原蛋白申请印度注册时需要注意地区差异，并根据当地的具体要求和实际情况进行准备和申请。建议与当地的医疗器械注册代理公司或律师事务所合作，以便更好地了解当地的情况和提供支持。