骨科机器人在菲律宾申请GMP质量体系审核的流程通常包括以下环节：

1. 申请和准备：首先，骨科机器人制造企业需要向菲律宾的认证机构提交GMP质量体系认证的申请。在此过程中，企业需要提供包括基本信息、质量管理体系文件和相关支持文件等在内的必要资料。

2. 文件审查：认证机构会仔细审查企业提交的文件，以验证其质量管理体系是否符合GMP的要求。如果文件存在不足之处，认证机构可能会提出建议或要求企业进行修订。

3. 初步评估：审核流程通常会从初步评估开始。认证机构的审核员可能会对企业进行远程或现场访问，以了解质量管理体系的基本情况，并评估其是否满足GMP的基本标准。

4. 审核计划制定：认证机构和企业之间会共同制定详细的审核计划。这个计划将包括审核的日期、地点、审核员的任命以及具体的审核范围等关键信息。

5. 现场审核：按照审核计划，审核员会亲自前往企业的制造设施进行现场审核。在现场，他们会深入检查企业的生产过程、相关文件和记录，以确保其完全符合GMP的标准。

6. 记录审核和文件复查：审核员会进一步检查企业的文件和记录，确保它们与企业的实际操作一致，并完全符合GMP的要求。

7. 审核结果通知和证书颁发：如果企业的GMP质量体系通过了认证机构的审核，认证机构会向企业发出审核通过的通知，并颁发相应的GMP认证证书。反之，如果审核未通过，认证机构会提供未通过的原因，并可能要求企业进行整改后再次申请审核。