在日本，重组胶原蛋白产品申请GMP（Good Manufacturing Practice，良好生产规范）质量体系审核的流程通常包括以下环节：

1. 了解法规与标准：

2. 首先，制造商需要详细了解和掌握日本关于GMP的法规、指导原则以及相关的技术标准。

3. 准备申请文件：

4. 准备详细的申请文件，包括公司的基本信息、产品的描述、生产工艺流程、质量控制体系、人员培训记录等。

5. 所有文件都需要按照PMDA（日本医药品医疗器械综合机构）的要求进行格式化和整理。

6. 提交申请：

7. 将申请文件提交给PMDA或指定的审核机构。

8. 初步审查：

9. 审核机构会对提交的申请文件进行初步审查，确认文件的完整性和合规性。

10. 如果文件存在缺陷或不符合要求，审核机构会要求制造商进行补充或修改。

11. 现场审核：

12. 在初步审查通过后，审核机构会进行现场审核，包括检查生产设施、设备、工艺流程、质量控制措施等。

13. 审核人员还会与企业的管理人员和员工进行交流，了解他们对GMP的理解和执行情况。

14. 审核报告与整改：

15. 审核结束后，审核机构会出具详细的审核报告，指出企业在GMP执行过程中存在的问题和不足。

16. 制造商需要根据审核报告中的建议进行整改，并在规定的时间内完成整改并提交整改报告。

17. 终审查与认证：

18. 审核机构会对制造商提交的整改报告进行终审查。

19. 如果审核机构认为制造商已经满足了GMP的要求，会颁发GMP认证证书。

20. 持续监督与审计：

21. 获得GMP认证后，制造商需要继续遵守GMP的要求，并接受PMDA或审核机构的定期或不定期的监督和审计。