在日本注册重组胶原蛋白产品的临床试验，主要需要遵循以下步骤：

1. 设计研究方案：制定详细的研究方案，包括试验设计、研究目的、入选和排除标准、治疗方案、终点指标等。确保方案符合MDR（医疗器械注册）的要求和相关的伦理准则。

2. 伦理审查：提交研究方案给伦理委员会进行伦理审查，确保试验设计和实施符合伦理标准。伦理委员会的批准是进行临床试验的前提。

3. 患者招募和知情同意：开始患者招募，确保符合入选标准的患者充分了解试验，并签署知情同意书。

在临床试验过程中，可能还需要注意以下几点：

1. 遵循严格的试验设计和实施标准，确保试验结果的准确性和可靠性。

2. 定期进行试验数据的收集和分析，及时发现和解决可能出现的问题。

3. 与伦理委员会保持密切沟通，确保试验过程符合伦理要求。

此外，在提交注册申请之前，还需要准备详细的注册申请材料，这些材料可能包括但不限于产品说明书、技术资料、质量管理体系、生产工艺、临床试验数据（如果适用）以及产品标签等。然后将准备好的申请材料提交给PMDA（日本药品和医疗器械管理局），进行后续的初步审查、技术评估、质量评估等流程。

以上步骤和注意事项可能因具体的产品和试验要求而有所不同，建议在实际操作前详细咨询相关机构或专家。